Le département de Mycologie médicale et Parasitologie est porté par des universitaires et hospitalo-universitaires permettant un ancrage dans des problématiques de santé. Les stratégies de recherche bénéficient d’une expertise en culture cellulaire, signalisation, biologie moléculaire, immunologie appliquée à la microbiologie, production de protéines recombinantes (plateforme P2R) et modèles in vivo. Ses activités concernent principalement les problématiques de résistance et de découverte de nouvelles cibles thérapeutiques.

Le département de Chimie Thérapeutique a une activité de Drug Discovery, à savoir de conception, de synthèse, de purification, d’élucidation structurale et d'étude des relations structure activité, de molécules originales hétérocycliques à vocation de candidats-médicaments antifongiques, antiparasitaires et antibactériens. Les propriétés physicochimiques et ADME-Tox des composés d’intérêt biologique sont également discutées dans l’ensemble des projets.

Le département Résistances Bactériennes étudie comment les interactions entre l’hôte, ses microbiotes et les médicaments (en particulier les médicaments anti-infectieux, sans exclusive) influencent la résistance bactérienne aux antibiotiques. Nous travaillons en particulier sur la colonisation digestive par les Entérobactéries multirésistantes, et testons entre autres la possibilité de traiter cette colonisation avec des bactéries vivantes (« probiotiques ») ou des polysaccharides (« prébiotiques »). Nous travaillons également sur l’amélioration de l’usage des antibiotiques, visant à garantir l’efficacité du traitement des infections bactériennes (en particulier, les pneumonies et les infections urinaires communautaires) tout en limitant au maximum le risque d’émergence, de persistance et de diffusion de bactéries multirésistantes.

Le projet scientifique s’articule autour de trois thématiques transversales dont l’animation est assurée par des binômes. L’exploration de ces trois thématiques fait appel à la multidisciplinarité entre les trois départements.

L’approche « One Health » est une approche synergique basée sur une interaction des soins de santé humaine, animale et environnementale en une seule entité : One Health. Parfaire nos connaissances et enrichir les approches actuelles développées par l’UR 1155 devient en effet nécessaire pour explorer les modèles historiques de notre unité et faire face à des infections potentiellement émergentes.

La résistance antimicrobienne et la persistance fongique et bactérienne augmentent significativement dans le monde entier et sont des enjeux majeurs de santé publique. La prise en charge de telles problématiques nécessite des approches intégrées et interdisciplinaires permettant d’appréhender les facteurs qui déterminent l’installation de ces phénomènes. Sur la base du plan stratégique du laboratoire IICiMed, la thématique Immunité, microbiote et persistance tient compte des données cliniques, de terrain et de ciblage thérapeutique obtenues par les thématiques "Approche One Health au service de l’étude de la persistance" et "Cibles et nouvelles approches thérapeutiques", afin d’explorer de façon intégrée les liens entre résistance, microbiote et immunité qui sont associés à la persistance humaine des pathogènes fongiques et des bactéries multi- et hautement résistantes aux antibiotiques et antifongiques.

Les traitements actuels des infections fongiques sont limités par la résistance aux antifongiques, la toxicité et les interactions médicamenteuses. Pour surmonter ces limitations, de nouvelles cibles doivent être identifiées pour le développement de composés antifongiques, ce qui pourrait améliorer notre arsenal thérapeutique. Nos travaux se concentrent sur plusieurs stratégies convergentes : Le ciblage de l’interaction entre les cochaperones et Hsp90 ainsi que l’axe calmoduline/calcineurine incluant Crz1 et FKS Le ciblage de la protéine kinase CaPkc1, la protéine kinase C impliquée dans les voies MAPK, et ayant un rôle de régulateur de l’intégrité de la paroi cellulaire durant la croissance, la morphogenèse et la réponse au stress pariétal Le décryptage de mécanismes de résistance pouvant émerger en développant une méthode d’anticipation d’émergence de résistance chez Candida (CasPER, Cas9-mediated Protein Evolution Reaction) L’utilisation de nouveaux outils d’adressage de principes actifs (Plateformes auto-immolables). Ces dernières sont aussi développées pour répondre à la problématique de la résistance aux antibactériens (BLSE, BMR), en particulier sur les bactéries colonisant le microbiote intestinal. De même, les traitements actuels des leishmanioses sont confrontés aux mêmes limites que les antifongiques (résistance, toxicité) et sont peu nombreux. Notre stratégie est de construire, avec nos partenaires (Institut Pasteur, BioCIS) du projet ANR TEXLEISH, une nouvelle ligne de traitements commune aux différentes espèces / aspects cliniques en développant des inhibiteurs de Leishmania CK1.